研究業績

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卒業論文・学位論文

• 卒業論文: プラズマと接触した固体表面上のイオンシース構造とその形成過程の数値解析, 京都大学工学部物理工学科宇宙基礎工学コース (2000.2).
• 修士論文: 不均一な質量分布を持つ離散格子系における非線形現象, 京都大学大学院工学研究科航空宇宙工学専攻 (2002.2).
• 博士論文: Studies on the Intrinsic Localized Modes in the One Dimensional Fermi-Pasta-Ulam Lattice, 京都大学大学院工学研究科航空宇宙工学専攻 (2005). (書誌情報)(学位論文要旨)

著書

• K. Yoshimura, Y. Doi, M. Kimura，Localized modes in nonlinear discrete systems, In M. Ohtsu and T. Yatsui(Eds.), Progress in Nanophotonics III, Springer (2014) (分担執筆).

学術論文

• A.B. Togueu Motcheyo, M. Kimura, Y. Doi, J.F.R. Archilla, Nonlinear bandgap transmission by discrete rogue waves induced in a pendulum chain, Physics Letters A, Vol. 497, 129334 (2024).
• T. Misu, H. Ishihara, S. Nagashima, Y. Doi, A. Nakatani, Visualization and analysis of skin strain distribution in various human facial actions, Mechanical Engineering Journal, Vol. 10, 23-00189 (2023).
• J. Takayanagi, Y. Doi, A. Nakatani, Modeling of a lattice model for nonlinear wave propagation in phononic crystals, Nonlinear Theory and Its Applications, IEICE, Vol. 14-2, pp.475-490 (2023).
• K. Yoshimura, G. Kato, Y. Doi, A symmetry of potential function and non-relaxation theorems of heat flux in nonlinear lattice, Physica D, Vol. 446, 133638 (2023).
• K. Yoshimura, Y. Doi, T. Kitamura, Heat transport in nonlinear lattices free from the Umklapp process, Physical Review E, Vol. 105, 024140 (2022)(Editors Suggestionに選定), arXiv:2108.01961 [nlin.CD].
• K. Yoshimura, Y. Doi, Existence of odd, even, and multi-pulse discrete breathers in infinite Fermi-Pasta-Ulam lattices, Journal of Differential Equations, Vol. 298, pp.560-608 (2021).
• S. Lee, M. Kato, Y. Doi, K. Hirata, A New Method to Control Intrinsic Localized Mode Using a Variable Magnetic Spring Structure, IEEE Transactioins on Magnetics, Vol. 58-2, 1300305 (2021).
• 土井祐介・小宮拓也・永島壮・中谷彰宏, 体心立方結晶における非線形エネルギー局在振動の探索, 材料, Vol. 70, No.4, pp.330-335 (2021).
• Y. Doi, K. Yoshimura, Construction of Symmetric Lattice for Smooth Mobility of Discrete Breathers, Nonlinearity, Vol. 33, 5142 (2020).
• J.F.R. Archilla, Y. Doi, K. Kimura, Pterobreathers in a model for a layered crystal with realistic potentials: Exact moving breathers in a moving frame, Physical Review E, Vol. 100, 022206 (2019).
• A.B. Togueu Motcheyo, M. Kimura, Y. Doi and C. Tchawoua, Supratransmission in discrete one-dimensional lattices with the cubic-quintic nonlinearity, Nonlinear Dynamics, Vol. 95, Issue 3, pp. 2461-2468 (2019).
• J.F.R. Archilla, Y. Zolotaryuk, Yu. A. Kosevich and Y. Doi, Nonlinear waves in a model for silicate layers, Chaos, Vol. 28, 083118 (2018).
• Y.Y. Yamaguchi and Y. Doi, Low-frequency discrete breathers in long-range systems without on-site potential, Phys. Rev. E, Vol. 97, 062218 (2018).
• Y. Watanabe, T. Nishida, Y. Doi, N. Sugimoto, Experimental demonstration of excitation and propagation of intrinsic localized modes in mass-spring chains, Physics Letters A, Vol. 382, pp.1957-1961 (2018).
• 雷霄雯・中谷彰宏・土井祐介・松永慎太郎, 面外変形を起こすキリガミ周期構造体の分岐解析, 材料, Vol. 67, no.2, pp.202-207 (2018).
• N. Higashiyama, Y. Doi and A. Nakatani, Nonlinear dynamics of a model of acoustic metamaterials with local resonators, Nonlinear Theory and Its Applications, IEICE., Vol. 8, No. 2 pp. 129-145 (2017).
• Y. Doi and K. Yoshimura, Symmetric potential lattice and smooth propagation of tail-free discrete breathers, Phys. Rev. Lett., Vol.117, 014101 (2016). (PDF)(Supplemental Material)
• Y. Doi and A. Nakatani, Structure and stability of discrete breather in zigzag and armchair carbon nanotubes Letters on materials, Vol.6 pp.49-53 (2016).
• M. Sato, T. Nakaguchi, T. Ishikawa, S. Shige, Y. Soga, Y. Doi and A.J. Sievers, Supertransmission channel for an intrinsic localized mode in a one-dimensional nonlinear physical lattice, Chaos, 25, 103122 (2015).
• Y. Doi and A. Nakatani, Modulational instability of a zone boundary mode and band edge modes in two-dimensional nonlinear lattices J. Phys. Soc. Jpn., Vol.81 124402 (2012).
• Y. Doi and A. Nakatani, Numerical study on unstable perturbation of intrinsic localized modes in graphene, Journal of Solid Mechanics and Materials Engineering, Vol.6 No.1, pp.71-80 (2012).
• Y. Doi and A. Nakatani, Intrinsic localized mode as in-plane vibration in two-dimensional Fermi-Pasta-Ulam lattices, Nonlinear Theory and Its Applications, IEICE, Vol. 3 No. 1, pp.67-76 (2012).
• Y. Kobayashi, Y. Doi and A. Nakatani, Strain dependence of formation mechanism of growth layer in molecular beam epitaxy of gallium nitride, Jpn. J. Appl. Phys., 49, 115601 (2010).
• 小林泰典・土井祐介・中谷彰宏, 窒化ガリウムのMBE成長における島形成の基板温度依存性と形態解析, 材料 59-2 pp.157-164 (2010).
• 政家利彦・土井祐介・中谷彰宏, 一定外力を付与した水素原子拡散理論とその分子動力学シミュレーションによる検討, 日本機械学会論文集A編 76-761 pp.52-61 (2010).
• T. Shimada, D. Shirasaki, Y. Kinoshita, Y. Doi, A. Nakatani and T. Kitamura, Infuluence of nonlinear atomic interaction on excitation of intrinsic localized modes in carbon nanotubes, Physica D, 239, pp.407-413 (2010).
• Y. Doi and K. Yoshimura, Translational asymmetry controlled lattice and numerical method for moving discrete breather in four particle system, J. Phys. Soc. Jpn., 78, 034401 (2009).
• Y. Doi, A. Nakatani and K. Yoshimura, Modulational instability of zone boundary mode and band edge modes in nonlinear diatomic lattices, Phys. Rev. E, 79, 026603 (2009).
• 政家利彦・土井祐介・中谷彰宏, 分子動力学法によるNi結晶中の水素拡散挙動とその素過程の解析, 材料 57-8 pp. 774-779 (2008).
• Y. Kinoshita, Y. Yamayose, Y. Doi, A. Nakatani and T. Kitamura, Selective excitation of intrinsic localized modes in atomic scales in carbon nanotubes, Phys. Rev. B, 77, 024307 (2008).
• Y. Yamayose, Y. Kinoshita, Y. Doi, A. Nakatani and T. Kitamura, Excitation of intrinsic localized modes in a graphene sheet, Europhys. Lett., Vol. 80, 40008 (2007).
• K. Yoshimura and Y. Doi, Moving discrete breathers in nonlinear lattice: resonance and stability, Wave Motion, Vol. 45, pp.83-99 (2007).
• Y. Doi and A. Nakatani, Manipulation of intrinsic localized modes by elastic waves on one dimensional anharmonic lattice systems, Key Engineering Materials, Vol. 340-341, pp.997-1002 (2007).
• K. Ikeda, Y. Doi, B.-F. Feng and T. Kawahara, Two types of chaotic breathers in two-dimensional Morse lattice with on-site harmonic potential, Physica D, Vol. 225, pp. 184-196 (2007).
• Y. Doi and A. Nakatani, Structures of discrete breathres in two dimensional Fermi-Pasta-Ulam lattices, Theoretical and Applied Mechanics Japan, Vol. 55, pp.103-110 (2006).
• 土井祐介, 山寄優, 中谷彰宏, 北村隆行, 非線形相互作用によるエネルギー局在構造（非線形局在モード）と材料の原子・分子スケールでのダイナミクスへの応用, 材料 55-7 pp. 700-705 (2006).
• Y. Doi and A. Nakatani, Interaction of intrinsic localized modes with structures in anharmonic lattice systems, Modeling Simul. Mater. Sci. Eng. 14 pp. S85-S94 (2006).
• B.-F. Feng, Y. Doi and T. Kawahara, A regularized model equation for discrete breathers in anharmonic lattices with symmetric nearest-neighbor potentials, Physica D 214 pp.33-41 (2006).
• B.-F. Feng, Y. Doi and T. Kawahara, Quasi-continuum approximation for discrete breathers in Fermi-Pasta-Ulam atomic chains, J. Phys. Soc. Jpn. 73 2100 (2004).
• Y. Doi, Energy exchange in collisions of intrinsic localized modes, Phys. Rev. E 68 066608 (2003).
• Y. Doi, Sensitive behavior of intrinsic localized mode in the system with impurity and random inhomogeneity, Wave Motion 38 pp.177-188 (2003).

国際会議

• J.F.R. Archilla, J. Bajārs, Y. Doi, M. Kimura, Nonlinear excitations in a silicate chain, Experiments and theory, Abstract of 2nd Japanese-Spanish symposium on localization and nonlinear phenomena in lattices and waves (JSLoc2024), 4 (2024.3).
• Y. Doi, Dynamics of waves in a pairwise interaction symmetric lattice, Experiments and theory, Abstract of 2nd Japanese-Spanish symposium on localization and nonlinear phenomena in lattices and waves (JSLoc2024), 7 (2024.3).
• A.B.T. Motcheyo, M. Kimura, Y. Doi, Supratransmission in Absorbing Discrete Optical Waveguide Arrays, Proc. of 2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023), 6112 (2023.9).
• H. Ono, Y. Doi, A. Nakatani, Nonlinear Energy Transport in Umklapp-Free Lattices with Cubic and Quartic Nonlinearity, Proc. of 2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023), 6161 (2023.9).
• Y. Watanabe, Y. Doi, Experimental and Numerical Study on Velocity of Nonlinear Localized Oscillation in a Mass-Spring Chain, Proc. of 2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023), 6193 (2023.9).
• J.F.R. Archilla, J. Bajārs, Y. Doi, M. Kimura, Spectrum of Polarobreathers in a Model for Layered Silicates, Proc. of 2023 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2023), 6230 (2023.9).
• Y. Doi, K. Yoshimura, Structure of pairwise interaction symmetric lattice for moving discrete breather, Abstract of 10th Internal Congress on Indusrial and Applied Mathematics (ICIAM2023), 00992 (2023.8).
• Y. Watanabe, Y. Doi, M. Kimura, Numerical experiment on nonlinear localized oscillation propagating in a mass-spring chain, Abstract of 10th Internal Congress on Indusrial and Applied Mathematics (ICIAM2023), 01278 (2023.8).
• J.F.R. Archilla, J. Bajārs, Y. Doi, M. Kimura, Spectral properties of nonlinear excitations in semiclassical systems with charge transport, Abstract of 10th Internal Congress on Indusrial and Applied Mathematics (ICIAM2023), 01557 (2023.8).
• J.F.R. Archilla, J. Bajārs, Y. Doi, M. Kimura, Ballistic Charge Transport by Polarokinks and Polarobreathers, Proc. of 2022 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2022), 519 (2022.12).
• A.B.T. Motcheyo, M. Kimura, Y. Doi, J.F.R. Archilla, Supratransmission-Induced Discrete Rogue Wave in Nonlinear Chain, Proc. of 2022 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2022), 580 (2022.12).
• Y. Doi, R. Yoneda, A. Nakatani, Numerical Simulation of Unstable Dynamics of Zone Boundary Modes in Pairwise Interaction Symmetric Lattices, Proc. of 2022 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2022), 603 (2022.12).
• J. Takayanagi, Y. Doi, A. Nakatani, Modeling of Dynamics of Nonlinear Wave Propagation in Phononic Crystals, Proc. of 2022 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2022), 626 (2022.12).
• Y. Watanabe, Y. Doi, Excitation and Interaction of Nonlinear Localized Oscillations in a Mass-Spring Chain, Proc. of 2022 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2022), 630 (2022.12).
• J.F.R. Archilla, J. Bajārs, Y. Doi, M. Kimura, Polarokinks and polarobreathers in a model for silicate layers, Book of Abstracts for the mini-coloquium: LONE 2022: Localized nonlinear excitations in condensed matter. Theory and experiments. in CMD29, 7 (2022.8).
• Y. Doi, A. Nakatani, Standing and traveling discrete breathers in bcc crystals, Book of Abstracts for the mini-coloquium: LONE 2022: Localized nonlinear excitations in condensed matter. Theory and experiments. in CMD29, 9 (2022.8).
• Y. Watanabe, Y. Doi, Experimental and numerical study on excitation and interaction of nonlinear localized oscillations in a mass-spring chain, Book of Abstracts for the mini-coloquium: LONE 2022: Localized nonlinear excitations in condensed matter. Theory and experiments. in CMD29, 11 (2022.8).
• J. Takayanagi, Y. Doi, A. Nakatani, Modeling of dynamics of nonlinear wave propagation in phononic crystals, Book of Abstracts for the mini-coloquium: LONE 2022: Localized nonlinear excitations in condensed matter. Theory and experiments. in CMD29, 12 (2022.8).
• Y. Doi, A. Nakatani, Molecular dynamics simulation of discrete breathers in three-dimensional crystals, Book of Abstracts for Localisation in Condensed Matter(LCM2021), CMD29 online series, 3 (2021.9).
• Y. Kosevich, A. Chetverikov, Y. Doi, Self-localization of supersonic negative-effective-mass electrons or excitons in 1D lattices, Book of Abstracts for Localisation in Condensed Matter(LCM2021), CMD29 online series, 6 (2021.9).
• A.B.T. Motcheyo, M. Kimura, Y. Doi, C. Tchawoua, Energy transmission in the forbidden band-gap of discrete nonlinear cubic–quintic Schrödinger lattices, Book of Abstracts for Localisation in Condensed Matter(LCM2021), CMD29 online series, 7 (2021.9).
• K. Yoshimura, Y. Doi, T. Kitamura, EConstruction of nonlinear lattice free from the Umklapp process and heat transport, Book of Abstracts for Localisation in Condensed Matter(LCM2021), CMD29 online series, 10 (2021.9).
• J.F.R. Archilla, Y. Doi, M. Kimura, A tight-Binding Model for Charge Transport in Silicate Layers, Proc. of 2020 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2020) (2020.11).
• Y. Doi, R. Wada, A. Nakatani, Interaction of Discrete Breather and Normal Modes in Pairwise Interaction Symmetric Lattice, Proc. of 2020 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2020) (2020.11).
• K. Yoshimura, Y. Doi, M. Ebisu, Heat Transport in Pairwise Interaction Symmetric Lattices, Proc. of 2020 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2020) (2020.11).
• Yu. A. Kosevich, A. P. Chetverikov, Y. Doi, Localization of negative-effective-mass electron by supersonic kink in 1D lattice, The 13th CHAOS 2020 International Conference (CHAOS2020) (2020.6).
• Y. Doi, R. Wada, A. Nakatani, Dynamics of discrete breathers in normal modes in a symmetric lattice, The 13th CHAOS 2020 International Conference (CHAOS2020) (2020.6).
• K. Shiki, Y. Doi, S. Nagashima, A. Nakatani, Spectrum Analysis on Kinks in FPU Lattice with Next-Nearest-Neighbor Interaction, Proc. of 2019 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2019), 9188 (2019.12).
• Y. Doi, S. Hashimoto, A. Nakatani, K. Shiki, Y. Doi, S. Nagashima, A. Nakatani, Spectrum Analysis on Kinks in FPU Lattice with Next-Nearest-Neighbor Interaction, Proc. of 2019 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2019), 9186 (2019.12).
• J.F.R. Archilla, Y. Doi, M. Kimura, A. Nakatani, Energy and Charge Transport in a Silicate Layer, In Proc. of 2019 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2019), 9184 (2019.12).
• K. Yoshimura, Y. Doi, Exact Solutions of Infinite Lattices with Long-Range Nonlinear Interactions, In Proc. of 2019 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2019), 9178 (2019.12).
• Y. Doi, Numerical Study on Discrete Breathers in 3D Crystals, Japanese-Spanish Symposium on Energy Localization in Nonlinear Lattices (JSLoc2019) (2019.9).
• S. Lee, K. Hirata, Y. Doi, N. Niguchi, M. Kato, Intrinsic Localized Mode Using Nonlinear Magnetic Springs, Proc. of 2019 19th International Symposium on Electromagnetic Fields in Mechatronics, Electrical and Electronic Engineering (ISEF2019), DOI 10.1109/ISEF45929.2019.9097039 (2 pages).
• Yu. S. Kosevich, Y. Doi, Localization and trapping of negative-effective-mass electrons by supersonic kinks in nonlinear chains with realistic interatomic potentials and electron-phonon interactions, First International Nonlinear Dynamics Conference (NODYCON 2019) (2019.2).
• M. Kimura, Y. Doi, and K. Yoshimura, Bifurcation of Intrinsic Localized Modes in Perturbed Pairwise Interaction Symmetric Lattice, In Proc. of 2018 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2018), pp.569-570 (2018.9).
• N. Uchida, Y. Doi, and A. Nakatani, Numerical Study on Dynamics of Nonlinear Discrete Bridge Induced by Pedestrians, In Proc. of 2018 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2018), pp.517-520 (2018.9).
• J.F.R. Archilla, Y. Doi, and M. Kimura, Breathers and Tail-Breathers in a Realistic Model of a Silicate, In Proc. of 2018 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2018), pp.513 (2018.9).
• Y. Doi, K. Yoshimura and A. Nakatani, Dynamics of Intrinsic Localized Modes in Pairwise Interaction Relative Symmetric Lattices, In Proc. of 2018 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA2018), pp.511-512 (2018.9).
• J.F.R. Archilla, Y.Doi, and M. Kimura, Nonlocal breathers as possible energy carriers in secondary tracks in muscovite, Abstracts of VI International Symposium on Strong Nonlinear Vibronic and Electronic Interactions in Solids, p.26 (2018.5).
• Y. Doi and K. Yoshimura, Dynamics of Moving Intrinsic Localized Modes in Pairwise Interaction Symmetric Potential Lattices, In Proc. of International Symposium on Intrinsic Localized Modes: 30th Anniversary of Discovery (ILM2018), p.33 (2018.1).
• K. Yoshimura and Y. Doi, Thermal Conduction in Symmetric Potential Lattices, In Proc. of International Symposium on Intrinsic Localized Modes: 30th Anniversary of Discovery (ILM2018), p.32 (2018.1).
• J.F.R. Archilla, F. M. Russell, Y. Zolotaryuk, Y.A. Kosevich and Y. Doi, Experiments and theory in solitary waves in muscovite mica, In Proc. of International Symposium on Intrinsic Localized Modes: 30th Anniversary of Discovery (ILM2018), p.12 (2018.1).
• G. Sun, Y. Doi and A. Nakatani, Numerical Study on Intrinsic Localized Modes in Carbon Nanotubes with Bending and Torsion, In Proc. of 2017 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2017), p.559 (2017.12).
• Y. Doi, K. Okamoto and A. Nakatani, Numerical Simulation of Nonlinear Vibration Modes in a Small Number Atomic System, In Proc. of 2017 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2017), p.558 (2017.12).
• G. Sun, Y. Doi, and A. Nakatani, Molecular dynamics simulation of intrinsic localized modes in two types of carbon nanotube, International Workshop on Nonlinear Energy Localization in Crystals and Related Media (NELC2016), P1(Poster) (2016.12).
• Y. Doi and A. Nakatani, Mobility of discrete breathers in a symmetric potential lattice, International Workshop on Nonlinear Energy Localization in Crystals and Related Media (NELC2016), p.7 (2016.12).
• Y. Doi and K. Yoshimura, Mobility of Discrete Breather in Truncated Pairwise Interaction Symmetric Lattices, In Proc. of 2016 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2016), p.685 (2016.11), Invited
• Y. Doi, Mobility of discrete breathers in a symmetric potential lattice, Workshop on Integrable and nonintegrable lattice models: theory and computation, (2016.7), Invited.
• Y. Doi, Discrete breathers in theoretical lattice and crystal, Workshop on Integrable and nonintegrable lattice models: theory and computation, (2016.7), Invited.
• Y. Doi, Structure and mobility of discrete breathers in a symmetric potential lattice, Workshop on travelling nonlinear energy loclaization (2015.12).
• N. Higashiyama, Y. Doi and A. Nakatani, Nonlinear Vibration Property of Local Resonators in Dynamics of an Acoustic Metamaterial, In Proc. of 2015 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2015), (2015.12), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Dynamics of Discrete Breathers in Carbon Nanotube, In Proc. of 2015 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2015), (2015.12), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Stability analysis of discrete breathers in carbon nanotube, International Workshop “Discrete Breathers in Crystals”, (2015.9), Invited.
• Y. Doi, Nonlinear atomic localization in crystals, 15th Workshop on Fine Particle Plasmas (WFPP15), (2014. 10).
• Y. Doi and A. Nakatani, Dynamics and Stability of Nonlinear Vibration Modes in Layered Structure of Magnesium, In. Proc. of International Symposium on Long-Period Stacking Ordered Structure and Its Related Materials 2014 (LPSO2014), Pos-42 (2014.10).
• N. Higashiyama Y. Doi and A. Nakatani, Nonlinear dynamics of a quasi-one-dimensional model of acoustic metamaterials, In Proc. of 2014 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2014), (2014.9).
• Y. Doi and K. Yoshimura, Constructing a lattice model supporting highly mobile discrete breathers, In Proc. of 2014 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2014), (2014.9), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Stability of discrete breather on atomic scale in deformed carbon structures, IUTAM Symposium 2014 Complexity of Nonlinear Waves (2014.9), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Numerical study of nonlinear vibrations in layered structure in magnesium, In Proc. of 2013 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications, 226 (2013), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Stability of nonlinear vibration modes in periodic structure of magnesium, In. Proc. of International Symposium on Atomistic Modeling for Mechanics and Multiphysics of Materials (ISAM4 2013), L-2 (2013).
• Y. Doi, S. Ishikawa and A. Nakatani, Numerical study on structure and stability of phonon modes in a model of layered strcture of magnesium, In. Proc. of International Symposium on Long-Period Stacking Ordered Structure and Its Related Materials 2012 (LPSO2012), Pos-22 (2012).
• Y. Doi and A. Nakatani, Modulational instability and chaotic breathers in two dimensional Fermi-Pasta-Ulam lattices, In. Proc. of 19th International Symposium on Nonlinear Acoustics (ISNA19), p.77 (2012), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Unstable dynamics of intrinsic localized modes in strained graphene, Abstracts of 2011 Kyoto Workshop on NOLTA, p.2 (2011).
• Y. Doi and A. Nakatani, Linear stability analysis of intrinsic localized modes in graphene, In Proc. of the 2011 World Congress on Advances in Structural Engineering and Mechanics (ASEM'11+), pp.3311-3315 (CD-ROM) (2011).
• Y. Doi and A. Nakatani, Intrinsic Localized Modes in Strained Graphene Sheet, In Proc. of 2011 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA2011), pp.604-607 (CD-ROM) (2011).
• Y. Doi and A. Nakatani, Dynamical stability of intrinsic localized modes in graphene sheets, In Proc. of International Symposium on Atomistic Modeling for Mechanics and Multiphysics of Materials (ISAM4), (2011).
• Y. Doi and A. Nakatani, Structure and stability of nonlinear vibration mode in graphene sheet, In Proc. of the 11th International Conference on the Mechanical Behavior of Materials (Procedia Engineering), Vol.10, pp.3402-3407 (2011).
• Y. Kinoshita, Y. Yamayose, Y. Doi, A. Nakatani and T. Kitamura: Selective excitations of intrinsic localized modes of atomic scales in carbon nanotubes, Third Asian-Pacific Congress on Computational Mechanics in conjunction with Eleventh International Conference on Enhancement and Promotion of Computational Methods in Engineering and Science (APCOM'07-EPMESC XI), p.375, (2007).
• K. Yoshimura and Y. Doi, Moving discrete breathers: Resonance and stability, The Fifth IMACS International Conference on Nonlinear Evolution Equations and Wave Phenomena: Computation and Theory (2007).
• Y. Doi and A. Nakatani, Discrete breathers in two dimensional Fermi-Pasta-Ulam lattice systems, The Fifth IMACS International Conference on Nonlinear Evolution Equations and Wave Phenomena: Computation and Theory (2007).
• Y. Doi and A. Nakatani, Manipulation of Intrinsic Localized Modes by Elastic Waves in One Dimensional Anharmonic Lattice Systems, AEPA06 (2006).
• Y. Doi and A. Nakatani, Dynamics of intrinsic localized modes in anharmonic lattice systems, Proceedings of ICCES '05, pp.1470-1475 (2005), Invited.
• Y. Doi and A. Nakatani, Interaction of intrinsic localized modes with structures in anharmonic lattice systems, Abstracts of International Anniversary Symposium on Molecular Dynamics Simulations, (2005)
• Y. Doi, Dynamics of discrete breathers in two dimensional lattice systems, Abstracts of 2005 International Conference on Scientific Computation and Differential Equations (2005)
• B.-F. Feng, Y. Doi and T. Kawahara, Regularized Model Equations for Intrinsic Localized Modes in Nonlinear Lattices, Abstracts of First SIAM Nonlinear Waves and Coherent Structure, (2004).
• Y. Doi, B.-F. Feng and T. Kawahara, Collisions of ILMs in the Fermi-Pasta-Ulam lattice and continuum model, Abstracts of First SIAM Nonlinear Waves and Coherent Structure, (2004).
• Y. Doi and B.-F. Feng, On the collision of intrinsic localized modes in 1D Fermi-Pasta-Ulam lattice, Proc. of The 32th International Summer School - Conference "Advanced Problems in Mechanics", pp118-127 (2004).
• Y. Doi, Some interactions of discrete breathers in the Fermi-Pasta-Ulam lattice systems, The 7th Tsukuba International Workshop in Chaos, Turbulence and Complex Systems, Tsukuba University, 2003.11.

国内学会・研究会報告集

• 土井祐介, 非線形格子系と離散ブリーザーの移動性について, 研究会「非線形物理学とその応用」 (2016.11).
• 土井祐介・吉村和之, 近似対称格子における離散ブリーザーの移動性, 日本物理学会2016年秋季大会 (2016.9).
• 土井祐介，原子スケールでの非線形振動・ダイナミクス,第26回格子欠陥フォーラム,(2016.9).
• 孫光輝・Lei Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, カーボンナノチューブにおける非線形局在モードの３次元構造の解析, マルチスケール材料力学シンポジウム(第21回分子動力学シンポジウム・第9回マイクロマテリアルシンポジウム)講演論文集, P30 (2016).
• 鈴木脩・Lei Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, 二次元材料のトポロジカル欠陥により形成される曲面構造の考察, マルチスケール材料力学シンポジウム(第21回分子動力学シンポジウム・第9回マイクロマテリアルシンポジウム)講演論文集, P8 (2016).
• 石丸知英・原田悠之介・Lei Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, 二次元カットパターン構造の一般化連続体力学に基づく解析, マルチスケール材料力学シンポジウム(第21回分子動力学シンポジウム・第9回マイクロマテリアルシンポジウム)講演論文集, P7 (2016).
• 松岡興二・Lei Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, 基準配置上で拘束を有する膜構造体のエネルギー最小化原理に基づく形態解析, 日本機械学会講演会論文集(関西支部第91期定時総会講演会), M206 (2016).
• 東山直樹・Lei Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, 局所振動子を有するメタマテリアルに基づいた準一次元非線形格子モデルの動力学特性, 日本機械学会講演会論文集(関西支部第91期定時総会講演会), M205 (2016).
• 松永慎太郎・Lei Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, 面外変形により伸長するキリガミ構造体の力学シミュレーション, 日本機械学会講演会論文集(関西支部第91期定時総会講演会), M202 (2016).
• 土井祐介，Structure and mobility of discrete breathers in a symmetric potential lattice, 日本物理学会北陸支部特別講演会(移動する非線形局在振動に関する研究会).
• 土井祐介・吉村和之，対称格子系における離散ブリーザーのダイナミクス，京都大学数理解析研究所研究集会「非線形波動現象の数理に関する最近の進展」(2015)．
• 土井祐介・中谷彰宏, カーボンナノチューブにおける非線形局在モードの線形安定性解析，日本機械学会講演会論文集(第28回計算力学講演会), (2015), 306(USB).
• 土井祐介・吉村和之, 対称格子系における離散ブリーザーのダイナミクス，京都大学数理解析研究所研究集会「非線形波動現象の数理に関する最近の進展」.
• 土井祐介・中谷彰宏, カーボンナノチューブにおける非線形局在モードの線形安定性解析，日本機械学会講演会論文集(第28回計算力学講演会), (2015), 306(USB).
• 河原永也・LEI Xiao-Wen・土井祐介・中谷彰宏, カーボンナノチューブの欠陥対の安定性解析, 第20 回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2015), P19(USB).
• 品川徹・土井祐介・中谷彰宏,双安定格子モデルを用いたエネルギー局在による構造変化ダイナミクスの検討, 第20 回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2015), P14(USB).
• 岡本和大・土井祐介・中谷彰宏, 小自由度原子系の構造転移ダイナミクスの動力学解析, 第20 回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2015), P13(USB).
• 西田拓展・渡邉陽介・土井祐介・杉本信正, 端のあるFermi-Pasta-Ulam格子の強制振動における非線形局在モードの励起，京都大学数理解析研究所研究集会「非線形波動現象のメカニズムと数理」.
• 東山直樹・土井祐介・中谷彰宏, 音響メタマテリアルの大振幅振動における動力学特性解析, 第19回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2014), P30(USB).
• 土井祐介・神谷和典・中谷彰宏, マグネシウム積層構造の非線形挙動と不安定性解析,日本金属学会講演概要集(2014年春季講演大会(第154回)), (2014).
• 神谷和典・中谷彰宏・土井祐介, 大振幅振動におけるマグネシウム合金の非線形挙動に関する不安定性評価, 日本機械学会講演論文集(関西支部第89期定時総会講演会), (2014), p.306.
• 木下光太郎・L. Xiaowen・土井祐介・中谷彰宏, 有限変形理論に基づく格子欠陥の配置力の評価と安定構造の解析, 日本機械学会講演論文集(関西支部第89期定時総会講演会), (2014), p.110.
• 秋山拓也・土井祐介・中谷彰宏・小川隆樹, くりこみ群を用いた非弾性結合法則の粗視化法の検討, 日本機械学会講演論文集(関西支部第89期定時総会講演会), (2014), p.107.
• Y. Doi, Nonlinear Energy Localization Modes in Crystals: Discrete Breather, Proceedings of the 25th Symposium on Phase Change Oriented Science (PCOS2013), (2013), pp.14-17, 招待講演.
• 土井祐介・中谷彰宏, マグネシウム積層構造の非線形フォノンモード解析, 日本機械学会講演論文集(第26回計算力学講演会), (2013), 1537.
• 王孝汝・土井祐介・中谷彰宏, 階層構造を有する破壊プロセス領域のき裂進展機構の解析, 日本機械学会講演論文集(第26回計算力学講演会), (2013), 1535.
• 土井祐介・中谷彰宏, マグネシウム積層構造体における非線形振動とその不安定化, 第18回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2013), P40(USB).
• 宮外佳範・土井祐介・中谷彰宏, 方程式フリー法を用いた長柱の波動伝ぱと変形挙動に関する解析, 第18回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2013), P39(USB).
• 土井祐介・中谷彰宏, 原子モデルによるマグネシウム積層構造の有限振動特性解析, 日本金属学会講演概要(2013年春期講演大会(第152回)), (2013), S6-5.
• 秋田光広・土井祐介・中谷彰宏, 有限変形理論に基づく格子欠陥を有する超弾性体の力学解析, 日本機械学会講演論文集(関西支部第88期定時総会講演会), No. 134-1 (2013), p.424.
• 中西諒・土井祐介・中谷彰宏, 材料非線形性の影響を考慮した表面弾性波の伝ぱに関する研究, 日本機械学会講演論文集(関西支部第88期定時総会講演会), No. 134-1 (2013), p.422
• 土井祐介・神谷和典・石川省吾・中谷彰宏, 経験的ポテンシャルを用いたマグネシウム積層構造体のフォノン構造と安定性解析, 軽金属学会第123回秋期大会講演概要, (2012), pp. 291-292.
• 土井祐介・石川省吾・中谷彰宏, 経験的ポテンシャルを用いたマグネシウム周期積層構造の振動モード解析, 第17回分子動力学シンポジウム講演論文集, (2012), P29(USB).
• 土井祐介・中谷彰宏・吉村和之, 離散ブリーザーの移動性に着目した対称格子の構成法, 日本物理学会講演概要集(第67回年次大会), Vol. 64, No. 1 (2012), p. 298.
• 定秀悠介・土井祐介・中谷彰宏, 階層構造を有する微視的弾性繊維モデルによる接着特性の解析, 日本機械学会講演論文集(関西支部第87期定時総会講演会), No. 124-1 (2012), p.511.
• 國枝直弘・土井祐介・中谷彰宏, 選択的二状態遷移による多分子モーターの運動特性の解析, 日本機械学会講演論文集(関西支部第87期定時総会講演会), No. 124-1 (2012), p.413.
• 奥山真司・土井祐介・中谷彰宏, 間欠泉の噴出様式に現れるパターン現象のマルチスケール数理モデルによる研究, 日本機械学会講演論文集(関西支部第87期定時総会講演会), No. 124-1 (2012), p.404.
• 劉賀彬・土井祐介・中谷彰宏, 軟化再硬化特性を有する弾塑性体の局所変形伝ぱ機構に関する有限要素解析, 日本機械学会講演論文集(関西支部第87期定時総会講演会), No. 124-1 (2012), p.401.
• 土井祐介・中谷彰宏, 格子の対称性による非線形局在モードの移動性の変化の解析, 京都大学数理解析研究所研究集会「非線形波動の研究の新たな進展」(2011).
• 土井祐介・中谷彰宏, ひずみを付加した結晶における非線形局在振動の安定性の解析, 日本機械学会講演論文集(第24回計算力学講演会(CMD2011)), pp. 281-282 (CD-ROM) (2011).
• 中西諒・土井祐介・中谷彰宏, 音響レンズにより形成される弾性波の伝ぱ挙動のシミュレーション, 日本機械学会講演論文集(M&M2011材料力学カンファレンス), PS15 (2011).
• 秋田光広・土井祐介・中谷彰宏, 積層構造体のキンク褶曲の力学解析, 日本機械学会講演論文集(M&M2011材料力学カンファレンス), PS14 (2011).
• 土井祐介・中谷彰宏, 有限温度下における非線形エネルギー局在構造の安定性の解析, 第1回マルチスケールマテリアルモデリングシンポジウム講演論文集, P58(USB) (2011).
• 奥山真司・土井祐介・中谷彰宏, 間欠泉の噴出様式とその形成メカニズムに関する検討, 第1回マルチスケールマテリアルモデリングシンポジウム講演論文集, P57(USB) (2011).
• 内田翔太・土井祐介・中谷彰宏, 格子ボルツマンモデリングを用いた流体中の弾性体の変形シミュレーション, 日本機械学会講演論文集(関西支部第86期定時総会講演会), No.114-1, 817 (2011).
• 松山拓馬・土井祐介・中谷彰宏, 方程式フリー法を用いた一次元格子動力学のマルチスケール解析, 日本機械学会講演論文集(関西支部第86期定時総会講演会), No.114-1, 814 (2011).
• 大崎真治・土井祐介・中谷彰宏, 格子欠陥モデルを用いた褶曲の力学モデルとその検討, 日本機械学会講演論文集(関西支部第86期定時総会講演会), No.114-1, 813 (2011).
• 大崎真治・土井祐介・中谷彰宏, 回位モデルを用いた褶曲の力学モデルとその検討, 第60回理論応用力学講演会講演論文集, GS01-08(USB) (2011).
• 内田翔太・土井祐介・中谷彰宏, 格子ボルツマン法を用いた流体と弾性固体の連成解析, 第60回理論応用力学講演会講演論文集, GS01-03(USB) (2011).
• 松山拓馬・土井祐介・中谷彰宏, 方程式フリー法を用いた一次元格子の振動モード解析, 第60回理論応用力学講演会講演論文集, GS03-08(USB) (2011).
• 土井祐介・中谷彰宏, 非線形エネルギー局在による結晶構造の変化の研究, 日本機械学会講演論文集(第23回計算力学講演会), Vol.10, No.2, 1030(CD-ROM) (2010).
• 松山拓馬・土井祐介・中谷彰宏, 方程式フリー法を用いた一次元格子の力学解析, 日本機械学会講演論文集(第23回計算力学講演会), Vol.10, No.2, 1014(CD-ROM) (2010).
• 土井祐介・中谷彰宏, グラフェンシートにおける炭素結合の大振幅振動の不安定化, 計算工学講演会講演論文集, Vol.15, pp.637-638 (2010).
• 定秀悠介・土井祐介・中谷彰宏, アワビを模倣した微視的弾性繊維モデルの巨視的引き剥がし力の異方性に関する解析, 計算工学講演会講演論文集, Vol.15, pp.635-636 (2010).
• 内田翔太・土井祐介・中谷彰宏, 流体中における弾性膜体の変形のモデリングの検討, 第15回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp.78-79 (2010).
• 土井祐介・中谷彰宏, 離散ブリーザーによる結晶の構造変化の検討, 京都大学数理解析研究所研究集会「非線形波動現象の数理と応用」 (2009).
• 政家利彦・土井祐介・中谷彰宏, 一定外力を受ける水素原子の拡散挙動の定式化とその分子動力学シミュレーションによる検証, 日本機械学会講演論文集(第22回計算力学講演会), No. 09-21, p. 272-273 (CD-ROM) (2009).
• 小林泰典・土井祐介・中谷彰宏, 窒化ガリウムのMBE成長における島の自己組織化の解析, 日本物理学会講演概要集（2009年秋季大会）, Vol. 64, No. 2, p. 817 (2009).
• 土井祐介・吉村和之, 非線形Klein-Gordon型格子における離散ブリーザーの存在と安定性, 日本物理学会講演概要集(2009年秋季大会), Vol. 64, No. 2, p.179.
• 土井祐介・中谷彰宏, グラフェンシートにおける非線形局在モードの構造と安定性, 第14回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp.18-19 (2009).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2原子結晶構造中での離散ブリーザーの存在と安定性, 京都大学数理解析研究所講究録, Vol.1645, pp. 66-71 (2009).
• 土井祐介・中谷彰宏・吉村和之, ２原子非線形格子におけるZone Boundary ModeとBand Edge Modeの変調不安定解析, 日本物理学会講演概要集(第64回年次大会), Vol. 64, No. 1, p. 331 (2009).
• 國分康明・土井祐介・中谷彰宏, 流体との相互作用を考慮した微小膜構造体の変形と物質輸送に関する研究, 日本機械学会講演論文集(関西支部第84期定時総会講演会), No. 94-1, p. 13-12 (2009).
• 土井祐介・中谷彰宏, １次元格子系における移動型非線形局在モードの衝突のダイナミクス, 信学技報, Vol. 108, No. 336, pp.1-5, (電気情報通信学会 非線形問題研究会（NLP）) (2008).
• 土井祐介・中谷彰宏, 原子配列の幾何形状に起因する非線形局在モードの励起に関する研究, 日本機械学会講演論文集(第21回計算力学講演会), No 08-33, pp.452-453 (CD-ROM) (2008).
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, バイアスエネルギー場における水素拡散の原子運動論的研究, 日本機械学会講演論文集(第21回計算力学講演会), No 08-33, pp.450-451 (CD-ROM) (2008).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元結晶構造中での離散ブリーザーの存在と安定性, 京都大学数理解析研究所研究集会「非線形波動現象の数理と応用」.
• 土井祐介・白崎大輔・木下佑介・中谷彰宏・北村隆行, カーボンナノチューブにおける非線形局在モードの励起構造の解析, 日本物理学会講演概要集, Vol. 63, No. 2, p. 267 (2008).
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, Ni双晶境界近傍の水素拡散挙動の原子運動論的研究, 日本機械学会講演論文集(M&M2008 材料力学カンファレンス), No. 08-6, OS0407 (CD-ROM, 2pages) (2008).
• 土井祐介・中谷彰宏, 結晶格子モデルにおける非線形局在モードの移動性についての検討, 第13回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp. 73-74, (2008).
• 木下佑介・白崎大輔・土井祐介・中谷彰宏・北村隆行, カーボンナノチューブにおける非線形局在モードと原子間相互作用の非線形性の関係, 第13回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp. 27-29 (2008).
• 政家利彦・土井祐介・中谷彰宏, Ni双晶境界近傍における水素拡散過程の分子動力学解析, 計算工学講演会論文集, Vol. 13, No. 2, pp. 571-574 (2008).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元Fermi-Pasta-Ulam格子系における離散ブリーザーの構造と安定性, 日本物理学会講演概要集, Vol. 63, No. 1, pp. 283 (2008).
• 松下和裕・土井祐介・中谷彰宏, マルチスケール解析の体系的な枠組み構築の研究, 日本機械学会講演論文集(関西支部第83期定時総会講演会), No. 84-1, pp. 6-23 (2008).
• 織田章宏・土井祐介・中谷彰宏, 表面運動する構造体による物体輸送機構の解明, 日本機械学会講演論文集(関西支部第83期定時総会講演会), No. 84-1, pp. 9-14 (2008).
• 土井祐介・木下佑介・中谷彰宏・北村隆行，非線形相互作用による局在振動の解析，第４回NCPフォーラム資料集.
• 木下佑介・山寄優・土井祐介・中谷彰宏・北村隆行, カーボンナノチューブにおける非線形局在モードの励起に関する分子動力学解析, 日本機械学会講演論文集(第20回計算力学講演会), No. 07-36 (2007), pp. 267-268.
• 土井祐介・吉村和之，非線形格子モデルにおける離散ブリーザーの移動性, 日本物理学会講演概要集, Vol. 62, No. 2, p. 337 (2007).
• 土井祐介・中谷彰宏，格子モデルでの局在振動構造とその安定性，日本機械学会講演論文集(2007年度年次大会), No. 07-1, pp. 39-40 (2007).
• 中谷彰宏・椋代雄太郎・土井祐介, X-FEMを用いた粒界と転位の相互作用の解析, 日本機械学会講演論文集(2007年度年次大会), No. 07-1, pp. 19-20 (2007).
  
• 土井祐介・中谷彰宏, ２次元格子系における非線形エネルギー局在と不均一構造の相互作用の解析, 日本計算工学講演会講演論文集,Vol. 12, No. 1, pp.433-434 (2007).
• 政家 利彦・中谷 彰宏・土井 祐介, Ni拡張転位構造近傍における水素原子拡散特性とその素課程に関する研究, 第12回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp. 34-37 (2007).
• 景山 泰裕・中谷 彰宏・土井 祐介, 分子動力学法による乾燥泡膜の気体透過機構の研究, 第12回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp. 17-20 (2007).
• 土井祐介・中谷彰宏, ２次元FPU格子系でのIntrinsic Localized Modeの構造の解析, 京都大学数理解析研究所講究録, Vol.1543, pp. 227-235 (2007).
• 冨田直哉・中谷彰宏・土井祐介, 流体中における弾性膜の変形解析へのフェーズフィールド法の適用, 日本機械学会関西支部第82期定時総会講演会講演論文集, No.074-1, p. 619 (2007).
• 土井祐介・中谷彰宏, 非線形局在モードによる格子スケールでのエネルギー輸送の解析, 日本機械学会講演論文集(第19回計算力学講演会), pp. 461-462 (2006).
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, Ni結晶中の水素原子の拡散過程における局所格子ひずみの解析, 日本機械学会講演論文集(第19回計算力学講演会), pp. 601-062 (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, ２次元格子系における非線形局在構造, 日本機械学会2006年度年次大会講演論文集, Vol. 1, pp. 55-56 (2006).
• 小林泰典・中谷彰宏・土井祐介, EAMポテンシャルを用いた鉄ナノ結晶の力学特性評価, 計算工学講演会論文集, Vol. 11, No. 2, pp. 603-606 (2006).
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, 格子ひずみを付与したNi結晶中の水素原子拡散過程の検討, 計算工学講演会論文集, Vol. 11, No. 2, pp. 589-592 (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, ２次元格子モデルにおける非線形局在モードの構造とダイナミクス, 計算工学講演会論文集, Vol. 11, No. 2, pp. 583-584 (2006).
• 松下和裕・土井祐介・中谷彰宏, ニューラルネットワークによる記憶メカニズムのモデル化, 計算工学講演会論文集, Vol. 11, No. 2, pp. 345-348 (2006).
• 正畠康行・土井祐介・中谷彰宏, 分布関数の発展方程式を用いた分子モーターの運動解析, 計算工学講演会論文集, Vol. 11, No. 1 pp. 317-320 (2006).
• 小林泰典・中谷彰宏・土井祐介, EAMポテンシャルを用いた鉄ナノ結晶の安定性と弾性定数評価, 第2回NCPフォーラム講演予稿集, pp. 25-28 (2006).
• 織田章宏・中谷彰宏・土井祐介, 複雑構造体の表面機能化に関する研究, 第2回NCPフォーラム講演予稿集, p. 22 (2006).
• 松下和裕・中谷彰宏・土井祐介, ニューラルネットワークを用いた記憶メカニズムのモデル化, 第2回NCPフォーラム講演予稿集, pp. 12-15 (2006).
• 正畠康行・中谷彰宏・土井祐介, 分布関数を用いた分子モーターの運動解析, 第2回NCPフォーラム講演予稿集, pp. 4-7 (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元格子モデルにおける非線形局在モードとそのポテンシャル依存性, 第11回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp. 97-100, (2006).
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, Ni結晶中の水素原子のトラップサイトと拡散経路の検討, 第11回分子動力学シンポジウム講演論文集, pp. 34-37 (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元格子系における非線形局在モードの構造, 京都大学数理解析研究所講究録, Vol. 1483, pp. 252-263 (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元格子系における離散ブリーザー, 日本物理学会講演概要集, Vol. 61, No. 2, p. 332 (2006).
• 角谷忠記・中谷彰宏・土井祐介, 接点移動による膜小胞の軸対称安定形状の解析, 日本機械学会関西支部第81期定時総会講演会講演論文集, p.1003, (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元格子系における準1次元離散ブリーザー, 第55回理論応用力学講演会講演論文集, pp.407-408 (2006).
• 土井祐介・中谷彰宏, 材料中における非線形局在モードの出現の可能性の検討, 第18回計算力学講演会講演論文集, pp.659-660 (2005).
• 神崎伸彦・中谷彰宏・土井祐介・格子ミスフィットを有する自己組織化単分子層の層間摺動特性, 第18回計算力学講演会講演論文集, pp.445-446 (2005).
• 山寄　優・土井祐介・中谷彰宏・北村隆行, 分子動力学法によるグラフェンシートにおける非線形局在モードの解析, 第18回計算力学講演会講演論文集, pp.657-658 (2005).
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元非線形格子系における非線形局在現象, 日本流体力学会年会2005講演論文集, p.282 (2005).
• 吉村和之, 土井祐介, 非線形格子における動く局在モードの数値計算, 日本物理学会講演概要集, Vol.60-2, p.294 (2005).
• 土井祐介・吉村和之, 非線形格子系における移動型の離散ブリーザーの数値計算法, 九州大学応用力学研究所研究集会報告 No.16ME-S1, 37 (2005).
• 吉村和之・土井祐介，非線形格子における動く局在モード解の数値計算法，京都大学数理解析研究所講究録1430「波の非線形現象の数理とその応用｣，pp.187-197 (2005).
• 土井祐介, 非線形格子における格子スケールのエネルギー局在現象, 第6回航空宇宙材料フォーラム講演要旨集, pp.59-66 (2004).
• 土井祐介, 不均一性をもつ1次元Fermi-Pasta-Ulam格子系におけるエネルギー局在, 京都大学数理解析研究所講究録1368「波動の非線形現象とその応用｣, pp197-204 (2004)
• 土井祐介, 非線形局在モードの衝突の数値シミュレーション, 京都大学数理解析研究所講究録1311「非線形波動現象の数理とその応用｣, pp199-211 (2003).
• 土井祐介, ランダムな質量分布を持つ格子系における非線形局在モード, 京都大学数理解析研究所講究録1271「非線形波動の構造と力学｣, pp41-50 (2002).

国内会議・研究会(発表のみ)

• 土井祐介,非線形格子に出現するエネルギー局在現象, 第10回ダイナミクスと制御研究会, (2012.7).
• 奥山真司・土井祐介・中谷彰宏, 間欠泉のリズムに関する物理シミュレーションと数理モデルに関する検討, 日本応用数理学会 2012年 研究部会連合発表会, (2012.3).
• 土井祐介・中谷彰宏, グラフェンにおける非線形局在モードの数値シミュレーション, 日本応用数理学会 2012年 研究部会連合発表会, (2012.3).
• 土井祐介, 2次元結晶における離散ブリーザーの構造とダイナミクス,2009年度機械工学における力学系理論の応用に関する研究会, (2010.3).
• 土井祐介・中谷彰宏, 非線形格子モデルにおけるエネルギー局在現象--- 分子動力学的アプローチによる局在構造の探索 ---, 近未来型の建築構造解析に関するワークショップ(GA09大阪) , (2009.7).
• 中谷彰宏・政家利彦・土井祐介, 分子動力学から金属の水素脆化を解明するための糸口, GASST(Global Analysis of Soil and Structure)研究会, (2009.3).
• 吉村和之・土井祐介, 非線形格子における局在波動 ～Discrete Breather～, 電気情報通信学会 非線形問題研究会（NLP）, (2008.12).
• 土井祐介, 非線形格子系における局在構造, 京都駅前セミナー, (2007.10).
• 土井祐介, 非線形局在モードの構造とそのダイナミクス, 京都大学(COE講演会), (2007.6).
• 土井祐介, 非線形局在モードの解析とその応用, 若手シンポジウム～新世代の研究者から材料研究への提言を！～(日本材料学会関西支部), (2006).
• 中谷彰宏・土井祐介, マイクロダイナミクスシミュレーションによる材料強度特性評価, 材料シンポジウム「材料が創造する持続的発展」～ナノスケールから地球スケール～(日本材料学会関西支部), (2005).
• 土井祐介，FPU-β格子系における非線形局在モードの衝突のダイナミクスとそのモデル化, 大阪大学大学院基礎工学研究科未来研究ラボ 非線形ダイナミクスラボ定期研究会, 大阪大学，2004年11月.
• 土井祐介, 材料中での非線形エネルギー局在の励起メカニズム, 第7回航空宇宙材料フォーラム, 日本航空宇宙学会, 2004年9月.
• 土井祐介，非線形格子モデルにおけるエネルギー局在現象，21世紀COEプログラム｢動的機能機械システムの数理モデルと設計論｣第2回シンポジウム，京都大学, 2004年5月.
• 土井祐介，非線形格子モデルにおける格子スケールの局在現象，日本材料学会第52期第3回分子動力学部門委員会講演会，日本材料学会(京都), 2004年3月.

解説記事

• 土井祐介，非線形格子模型におけるエネルギー局在構造とその応用，日本機械学会誌, Vol.110-1060 p.218 (2007).

その他報告集

• 北村隆行・土井祐介，非線形局在モードの準粒子モデルとアモルファス部材の動特性解析，21世紀COEプログラム「動的機能機械システムの数理モデルと設計論」H16年度 研究成果報告書, pp.39-44 (2005).
• 土井祐介・中谷彰宏, 非線形局在モードの構造およびダイナミクス, 第1回非線形テクノサイエンス講演会予稿集, (2006), pp. 5-6.
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, Ni中の格子欠陥近傍における水素拡散異方性に関する研究, 第1回非線形テクノサイエンス講演会予稿集, (2006), pp. 81-82.
• 土井祐介・中谷彰宏, 2次元非線形格子モデルにおける面内振動の局在化, 第2回非線形テクノサイエンス講演会予稿集, (2007), pp. 3-4.
• 政家利彦・中谷彰宏・土井祐介, Ni結晶中の水素拡散特性とその素過程に関する分子動力学シミュレーション, 第2回非線形テクノサイエンス講演会予稿集, (2007), pp. 20-21.